SeuratData数据集-包含了各种常用的公共数据 devtools::install_github('satijalab/seurat-data')#安装 InstallData("pbmc3k")#安装数据集 ?pbmc3k ?ifnbDataset Version Summary species system ncells tech notes Installed InstalledVersioncbmc.SeuratData cbmc 3.0.0 scRNAseq and 13-antibody sequencing of CBMCs human CBMC (cord blood) 8617 CITE-seq TRUE 3.0.0hcabm40k.SeuratData hcabm40k 3.0.0 40,000 Cells From the Human Cell Atlas ICA Bone Marrow Dataset human bone marrow 40000 10x v2 FALSE 3.0.0ifnb.SeuratData ifnb 3.0.0 IFNB-Stimulated and Control PBMCs human PBMC 13999 10x v1 TRUE 3.0.0panc8.SeuratData panc8 3.0.0 Eight Pancreas Datasets Across Five Technologies human Pancreatic Islets 14892 SMARTSeq2, Fluidigm C1, CelSeq, CelSeq2, inDrops TRUE 3.0.0pbmc3k.SeuratData pbmc3k 3.0.0 3k PBMCs from 10X Genomics human PBMC 2700 10x v1 TRUE 3.0.0pbmcsca.SeuratData pbmcsca 3.0.0 Broad Institute PBMC Systematic Comparative Analysis human PBMC 31021 10x v2, 10x v3, SMARTSeq2, Seq-Well, inDrops, Drop-seq, CelSeq2 HCA benchmark FALSE 3.0.0

linux下R包安装失败的几点注意事项 首先检查是否Rootsudo R非root无法写入文件查看报错日志，是不是有R包的依赖需要通过apt软件包管理器的方式安装。因为R的权限没有这么大再查看日志是不是有包因为网络问题下载失败若确实是因为网络无法下载，有两种解决办法1） 换源下载2）wget下载到本地后手动安装install.packages("文件路径及文件名")但这种方式首先要解决依赖，不然还是白搭

linux 小命令 groupadd group useradd user usermod -G group user#给user赋予group的权限,并移除其他user 的group usermod -a -G group user#给user增加group的权限 chown -R user:group ./ pip config set global.index-url https：//pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/ apt install default-jdk#安装Java ##注意我删除了这个软件包 libstaroffice-0.0-0/oldstable,now 0.0.6-1 amd64 [installed,auto-removable]

Linux 与 OMV 系统相关问题 omv-salt deploy run fstab重建OMV的 fstab的分区表

装Seafile时出现的两个问题 无法运行索引谜之安全措施导致seafile不能以root用户运行索引切换到外接ext4硬盘后无法运行seahub.shomv默认挂载时加入了noexe参数,导致权限不够无法运行