使用R快速查看GEO数据库对应的实验信息

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连祈
2024-10-23 / 0 评论 / 2 阅读 / 正在检测是否收录...
# 安装GEOquery包
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("GEOquery")

# 载入GEOquery
library(GEOquery)

# 下载GSE数据集
gse <- getGEO("GSEXXXXXX", GSEMatrix = TRUE)

# 查看样本的pData信息
pData(gse[[1]])#针对性修改
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